PLINKの使い方 3 〜集団の階層化〜 16:32 Add Comment ゲノムワイドなSNPを用いて集団の階層化(補正)を行う。 参考論文 Data quality control in genetic case-control association studies 論文内でのIBSおよびIBDの定義 identity-by-s... Read More
PLINKの使い方 2 〜データクオリティの評価〜 13:34 Add Comment データクオリティの評価方法。 ・http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/summary.shtml ・"Data quality control in genetic case-control association s... Read More
PLINKの使い方 1 〜フォーマット整形〜 14:01 Add Comment 1. PLINK独自のフォーマットについて PLINKで解析をするために、まずPLINK独自のフォーマットにデータを整形する必要がある。研究デザインにあわせていくつかのフォーマットが用意されている。 http://pngu.mgh.harvard.edu/~purce... Read More