ゲノムワイドなSNPを用いて集団の階層化(補正)を行う。 参考論文 Data quality control in genetic case-control association studies 論文内でのIBSおよびIBDの定義 identity-by-s...
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Home / Archive for 5月 2013
PLINKの使い方 2 〜データクオリティの評価〜
データクオリティの評価方法。 ・http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/summary.shtml ・"Data quality control in genetic case-control association s...
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PLINKの使い方 1 〜フォーマット整形〜
1. PLINK独自のフォーマットについて PLINKで解析をするために、まずPLINK独自のフォーマットにデータを整形する必要がある。研究デザインにあわせていくつかのフォーマットが用意されている。 http://pngu.mgh.harvard.edu/~purce...
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